微生物肥料中的微生物在土壤有機(jī)質(zhì)的營養(yǎng)下，大量增殖，新陳代謝強(qiáng)度大為增強(qiáng)，從而分解土壤中有害的化學(xué)殘留。例如尿素和含尿素復(fù)合肥在制造過程中因溫度控制失當(dāng)，產(chǎn)生縮二脲，縮二脲會造成植物燒根，如果同時施用微生物肥料可以分解縮二脲。形成有利于植物生長的氮肥——氨離子。再如前茬由于除草劑使用過量，影響二茬作物生長，如果在二茬作物栽培前就大量使用微生物肥料，前茬除草劑對二茬作物的毒害作用將大為減輕。由于長期連年使用微生物肥料，殘留于土壤中的化學(xué)農(nóng)藥也會逐年減少。許多微生物肥料中的微生物能降解有機(jī)磷農(nóng)藥，并使其中的有機(jī)磷轉(zhuǎn)化為可溶磷肥，長期使用微生物肥料，由于微生物與有機(jī)質(zhì)的共同作用吸附、鈍化了土壤中的重金屬，減少了植株和果實(shí)中的重金屬，減少了農(nóng)作物中的化學(xué)殘留，減少了有害物質(zhì)對人類健康的損害，提高了農(nóng)產(chǎn)品的銷售收益，也改善了農(nóng)作物生產(chǎn)的環(huán)境。
